Evaluación del tamaño de genoma en siete subpoblaciones de yuca (manihot esculenta crantz) representativas del banco de germoplasma de CIAT por citometría de flujo
El tamaño del genoma de las plantas difiere entre especies o de variedad a variedad y es importante hacer comparaciones y mediciones genómicas. Al estimar el tamaño del genoma se ha podido modelar la dinámica de los procesos de diversificación genómica en las plantas angiospermas siendo estas el gru...
| Autor Principal: | Novoa Montenegro, Nicolás Alberto |
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| Formato: | info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| Idioma: | spa |
| Publicado: |
Universidad de La Salle. Departamento de Ciencias Básicas. Biología
2018
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| Materias: | |
| Acceso en línea: |
http://hdl.handle.net/10185/22272 |
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| Sumario: |
El tamaño del genoma de las plantas difiere entre especies o de variedad a variedad y es importante hacer comparaciones y mediciones genómicas. Al estimar el tamaño del genoma se ha podido modelar la dinámica de los procesos de diversificación genómica en las plantas angiospermas siendo estas el grupo más diverso. El CIAT (Centro Internacional de Agricultura Tropical) ha estado evaluando la diversidad genética en yuca (Manihot esculenta Crantz) usando polimorfismos de nucleótido único (SNPs) como marcadores moleculares para el descubrimiento de genes, caracterización de poblaciones genéticamente similares e identificación de duplicados en germoplasma; para el caso de la yuca se han determinado que existen 7 subpoblaciones latinoamericanas las cuales se pueden encontrar in vitro en el banco de germoplasma del CIAT. El propósito de este trabajo fue determinar el tamaño de genoma de las 7 subpoblaciones de yuca y sus pares silvestres con el fin de determinar si existe o no diversificación en este carácter en la yuca. Las estimaciones del tamaño del genoma se generaron usando citometría de flujo de muestras in vitro de las poblaciones cultivadas y silvestres del Manihot almacenadas en el banco de germoplasma del CIAT. Se utilizó yoduro de propidio (PI) como agente intercalante y DAPI como colorante cromosómico, permitiendo el recuento cromosómico usando un microscopio de fluorescencia. Las plantas de yuca a las que se les realizó conteo cromosómico fueron identificadas como diploides. Se determinó que el tamaño del genoma varía significativamente entre las poblaciones americanas de yuca (Manihot esculenta Crantz). A nivel de género, sin embargo, la comparación entre la yuca cultivada, el conjunto denominado CROP y los parientes silvestres (WILD y sub grupos) no se observaron diferencias significativas. Se observó que el tamaño del genoma de la yuca cultivada (Manihot esculenta Crantz) muestra diversificación / variación, mientras que el tamaño del genoma no varía al ser comparada con las accesiones de yuca silvestre, como M. flabellifolia y M. trisitis. Esto puede indicar que los procesos de selección antrópica de la yuca cultivada tienen un efecto significativo para conservar el tamaño de genoma a lo largo del tiempo, debido a la multiplicación clonal de la yuca. Algunos de los genomas evaluados como más grandes pueden potencialmente ser usados como genomas de referencia para estudios genómicos a futuro. Es evidente que los procesos de mejoramiento convencional, cuyo objetivo es fijar o acentuar características de interés agronómico basados en la selección de materiales promisorios, ha causado una pérdida de información genética. Es necesario realizar estudios adicionales que comparen estas diferencias a nivel estructural, como por ejemplo la secuenciación del genoma, el bandeo tipo FISH las cuales permiten caracterizar estas variaciones en el genoma se caracterizan en términos de tamaño y estructura de manera comparativa con muestras de Manihot silvestres |
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