Caracterización molecular y análisis filogenético de hongos microscópicos asociados a manchas foliares en hojas de uvilla (Physalis peruviana L.) en varias localidades del cantón Quito, Pichincha.
Los cultivos de uvilla (Physalis peruviana L.) son susceptibles a diversos factores físicos, químicos y biológicos que afectan a varias estructuras de la planta, principalmente a las hojas. En Ecuador se han identificado morfológicamente a los hongos responsables de patologías en el tejido foliar si...
| Autor Principal: | Díaz Granda, José Luis |
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| Formato: | bachelorThesis |
| Idioma: | Spanish / Castilian |
| Publicado: |
PUCE
2017
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| Materias: | |
| Acceso en línea: |
http://repositorio.puce.edu.ec/handle/22000/12516 |
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| Sumario: |
Los cultivos de uvilla (Physalis peruviana L.) son susceptibles a diversos factores físicos, químicos y biológicos que afectan a varias estructuras de la planta, principalmente a las hojas. En Ecuador se han identificado morfológicamente a los hongos responsables de patologías en el tejido foliar sin llegar a nivel de especie. En este trabajo se caracterizó molecularmente hongos microscópicos aislados de manchas foliares en hojas de uvilla en el cantón Quito. Además, se realizó un análisis filogenético mediante la aplicación de los métodos de Neighbor joining (NJ), Maxima Verosimilitud e Inferencia Bayesiana para dar un mayor soporte a la identificación. La identificación molecular de 130 aislados de microhongos se realizó mediante la amplificación de la región ITS (Espaciadores Internos Transcritos) del ADN ribosomal. Las secuencias de ADNr obtenidas fueron comparadas con aquellas disponibles en el GenBank del NCBI mediante el uso de la herramienta BLAST, obteniendo porcentajes de identidad de 97 a 100%. Como resultado, se identificaron 41 especies distintas de microhongos pertenecientes al phylum Ascomycota. Los hongos Alternaria sp., A. tenuissima, Epicoccum nigrum, Diaporthe sp., Xylaria multiplex y Colletotrichum brevisporum fueron aislados en cantidades mayores que las demás. El género Alternaria cuenta con el mayor número de especies, las cuales están asociadas a patologías en la hoja de uvilla. El análisis filogenético utilizó como matriz las secuencias de los aislados y secuencias de GenBank para la generación de dos árboles filogenéticos. El árbol Bayesiano resultante fue el mejor en cuanto a topología y valores de soporte (≥0,95). |
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