Biodiversidad fúngica endófita y epífita de Citrus sinensis, naranjo dulce, de dos localidades de la Región Litoral del Ecuador

La naranja dulce, Citrus sinensis, es cultivada y comercializada en todo el mundo. La biodiversidad fúngica endófita y epífita de esta especie vegetal proveniente de dos localidades de la región litoral del Ecuador fue investigada. Un total de 96 muestras (hojas sanas, frutos sanos y frutos con p...

Descripción completa

Autor Principal: Moya Maldonado, Alexandra Elizabeth
Formato: bachelorThesis
Idioma: Spanish / Castilian
Publicado: PUCE 2017
Materias:
DNA
Acceso en línea: http://repositorio.puce.edu.ec/handle/22000/12506
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Sumario: La naranja dulce, Citrus sinensis, es cultivada y comercializada en todo el mundo. La biodiversidad fúngica endófita y epífita de esta especie vegetal proveniente de dos localidades de la región litoral del Ecuador fue investigada. Un total de 96 muestras (hojas sanas, frutos sanos y frutos con presencia de lesiones superficiales) de la localidad de Quevedo-Los Ríos y El Empalme-Guayas, fueron procesadas en los laboratorios de la Escuela de Bioanálisis de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador. Cuarenta y nueve hongos tanto endófitos como epífitos se aislaron. Para la identificación molecular, se realizaron extracciones de ADN y secuenciaciones de la región ITS de los genes ribosomales. Mediante la herramienta BLAST se comparó las secuencias del estudio con las del Banco de Genes del NCBI, de esta forma se identificaron treinta y tres hongos a nivel de género y se obtuvieron 18 especies distintas. Tanto en la micobiota endófita como epífita, Epicoccum sp. fue el género más abundante. E. nigrum fue la especie epífita más aislada; mientras que Fusarium sp. fue el segundo género endófito más frecuente. La diversidad de hongos endófitos y epífitos fue determinada utilizando los índices ecológicos: Riqueza de especies, Margalef, Shannon-Viewer, Simpson y Jaccard. La localidad de Quevedo posee una mayor riqueza de especies y un índice de Margalef mayor (4.6). Además, los resultados sugieren que Quevedo posee alta heterogeneidad (H`=2.58) mientras que la localidad de El Empalme muestra una dominancia de especies mayor (D= 0.18) especialmente del hongo Epicoccum nigrum. Únicamente tres especies fueron compartidas por las dos localidades Epicoccum nigrum, Epicoccum sp. y Leptosphaerulina chartarum (Ij=0,38). Este estudio demuestra que, Citrus sinensis está constituido por micobiota endófita y epífita variada. El análisis filogenético basado en el método Neighbor- Joining generó un dendograma con Ascomycota como grupo general y cinco grupos internos pertenecientes a la subdivisión Pezizomycotina.