Detección de mutaciones puntuales en aislados clínicos de Escherichia coli resistentes a fluoroquinolonas

Una infección de tracto urinario es la invasión de un agente patógeno en el sistema urogenital. Esta constituye la segunda infección más frecuente mundialmente, solo superada por infecciones gastrointestinales. La mayoría de los casos se presentan como una inflamación en las zonas afectadas; aunque...

Descripción completa

Autor Principal: Quelal Madrid, Francisco Antonio
Formato: bachelorThesis
Idioma: Spanish / Castilian
Publicado: PUCE 2017
Materias:
Acceso en línea: http://repositorio.puce.edu.ec/handle/22000/13986
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Sumario: Una infección de tracto urinario es la invasión de un agente patógeno en el sistema urogenital. Esta constituye la segunda infección más frecuente mundialmente, solo superada por infecciones gastrointestinales. La mayoría de los casos se presentan como una inflamación en las zonas afectadas; aunque existen casos de pacientes asintomáticos. El 95,00% de las infecciones son por Escherichia coli y el 5,00% restante por Klebsiella, Proteus mirabilis y Acinetobacter baumanii. El tratamiento para controlar las infecciones de tracto urinario son las fluoroquinolonas. Su extendido uso ha generado la aparición de variantes resistentes a la terapia con fluoroquinolonas. El objetivo del estudio fue identificar las mutaciones puntuales en genes en la Región Determinante de Resistencia a Quinolonas (QRDR) en aislados de E. coli resistente a fluoroquinolonas obtenidas de muestras de orina, en un hospital de Quito. Se colectaron 307 aislados, y se seleccionaron 72 E. coli que fueron identificadas por pruebas bioquímicas y MALDI-TOF. El perfil de sensibilidad fue realizado con el sistema VITEK 2™. La extracción de ADN se realizó siguiendo las especificaciones del kit Wizard™ Genomic DNA Purification de Promega ®. La amplificación de la región QRDR de los genes gyrA, gyrB, parC y parE se realizó con iniciadores específicos y su identificación fue por electroforesis en gel de agarosa al 1%. Los productos de PCR fueron purificados mediante el kit de Invitrogen™, secuenciados por la empresa MACROGEN Inc., y las secuencias analizadas con el software GENEIOUS 5.6.7. De los 72 aislados el 77,78% provenían de mujeres y 22,22% de hombres. El análisis por VITEK 2™ reveló que 58,33% muestras de E. coli presentaron el fenotipo BLEE, el 100,00% fueron resistentes a ciprofloxacina y 93,06% a levofloxacina. El análisis de secuencias reveló una mayor acumulación de mutaciones en el gen parC. En parE se encontró que el 44,44% eran fenotipo silvestre. En el gen gyrA se observaron solo mutaciones ya reportadas anteriormente; en gyrB solo el 15,28% presentaron mutaciones. El estudio permite entender cómo se desarrolla esta resistencia en la población local y reportar la resistencia a fluoroquinolonas encontrada en un hospital de tercer nivel de la ciudad de Quito.